本篇文章给大家谈谈微阵列芯片,以及微阵列芯片有哪些对应的知识点,希望对各位有所帮助,不要忘了收藏本站!
(1)制备靶点
从生物标本中提取核苷酸并进行标记;
(2)杂交
让靶点与芯片上的cDNA或寡核苷酸序列进行孵育;
(3)获取数据
扫描与探针杂交的靶点表现出来的信号强度
(4)数据分析
从大量数据中得出具有生物学意义的结论
微阵列芯片技术通过测定能够与探针杂交的mRNA的数量,反映表达此mRNA的基因的转录情况,芯片的构建首先要根据研究的需要选择基因及相应的探针,其次是从标本中提取mRNA,并制备出靶点,然后将靶点加入芯片,进行孵育杂交、冲洗掉没有杂交的样品以及扫描等操作,得到原始数据,再将这些数据进行标准化和统计分析后得到结论 ,构造适当的微阵列芯片是开展后续研究的基础。
微阵列芯片是微流控芯片的一种。微阵列芯片可以视作微流控芯片流体流速为零的状态。
具体的分类方式还是要看研究领域,印象里研究芯片的组两者都做,侧重不一样而已。大牛可能会互相争一争谁属于谁的问题。
另外,微流控芯片目前较多的叫法可能是Lab-on-a-chip。
收费
属于私人研发的软件使用时需要收取一定的费用。
LuxScan Dx24微阵列芯片扫描仪是博奥生物zei新推出的高通量(24片)微阵列芯片扫描仪产品。
此产品是以 LuxScan 10K系列扫描仪为基础的新一代激光共聚焦微阵列分析系统,在继承原有性能优势的基础上,提高了检测通量和自动化程度,拥有更高的性价比优势。扫描速度是Luxscan 10K的1.2倍,足以满足诊断的快速需求。
转录组代表存在于细胞中RNA的全部类型,包括mRNA、rRNA、tRNA以及其它各种非编码RNA等。转录组是了解细胞过程的主要手段,微阵列(Microarray)和RNA-seq(RNA sequencing)是转录组分析中的两种主要技术。它们的主要区别在于,微阵列基于预先设计的标记探针与目标cDNA序列的杂交,而RNA-seq通过测序技术对cDNA链进行直接测序。
微阵列取决于杂交探针,根据杂交信号强度定量基因相对表达水平。
首先从样品中提取总RNA,然后构建cDNA文库。将cDNA与预先设计的带荧光标记的DNA探针在固体表面(spot matrix)混合,互补序列将与微阵列中的标记探针杂交。通过检测微阵列的探针荧光强度,这些探针代表了不同的基因,可获得各基因的相对表达谱。
一般而言,微阵列探针的荧光强度应与样品中互补cDNA(代表转录物)的丰度成正比。但是该技术的准确性取决于所设计的探针,已知序列的碱基组成以及探针杂交的亲和力,因此具有局限性。微阵列技术不能用低丰度的转录本进行,且不能区分同工型以及鉴定遗传变异。此外,探针也常伴随交叉杂交,非特异性杂交等问题。
RNA-seq是一种快速且高通量的方法,不依赖于预先设计的探针或已知的序列碱基特征,因此具有较高的灵敏度和检测新基因以及遗传变异的能力。
首先提取总RNA并在纯化后片段化处理,然后构建cDNA文库,使用高通量测序的方法对cDNA进行测序。获得测序序列后比对到参考基因组上(或者从头组装转录本后再比对),根据测序序列的覆盖情况定量基因表达。
理论上,如果测序深度足够深,则可以覆盖到所有基因,包括尚未发现的新基因,并能实现全长基因水平的定量。并且RNA-seq本身是一种测序技术,能获得基因的碱基组成信息,因此除了用于定量基因表达外,还可用于基因组结构研究,这是微阵列芯片无法比拟的。但是高通量的方法存在一定的假阳性问题是不可忽视的,并且二代测序在建库时也存在非特异性扩增的偏移,三代测序定量相对准确但价格昂贵。
就目前来说,使用RNA-seq进行转录谱和芯片研究都存在,且RNA-seq居多。主要原因,一是数据量大,覆盖基因组范围更广;二是不受物种基因组是否已知所限制;三是RNA-seq数据的灵活度高,并能用于基因组结构分析。
常用的生物芯片分为三大类:即基因芯片、蛋白质芯片和芯片实验室.
微阵列芯片有时被通俗的称为“生物芯片(Biochip)”.
而基因芯片有时也被称作生物芯片.
所以两者既包含又并列吧,看具体情况.
给你百科,你看看去.
基因芯片
微阵列芯片
微阵列芯片的优势在于可同时扫描大量感兴趣的基因,但其研究的瓶颈也在于此。一次实验会产生大量的数据, 如何分析这些数据并得出在生物学上有意义的结论 , 是微阵列芯片技术进一步发展完善的重要课题。在这方面需要借助于计算机技术和多种统计学方法。在现在应用的多种数学模型之间还没有进行过大规模的对照研究 , 因而对于它们的效能尚不能给予充分 、 全面的评估。
目前, 在医学研究中 , 数据分析方法在总体上分为两大类:无监控集簇分析和有监控集簇分析。前者比较单纯的从数学角度按照基因表达的相似性将基因分组 , 这有助于发现新的目的基因或提供新的疾病信息 , 如新的分型 、 影响预后的因素等。后者需要结合现有的专业知识进行分析, 适用于疾病归类。这对于传统诊断手段是一个有益的补充。
另外, 在目前进行的许多微阵列芯片研究中,每次研究的基因数目很大 , 而参与实验的样本量较少。这一现象不利于得到稳定的和具有良好可重复性的实验结果。
关于微阵列芯片和微阵列芯片有哪些的介绍到此就结束了,不知道你从中找到你需要的信息了吗?如果你还想了解更多这方面的信息,记得收藏关注本站。
发布时间:2022-12-05 17:17
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