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能否详细描述一下两条带的位置,另外你以什么作为template?cDNA?因为一般情况下引物二聚体的条带都是或多或少的存在的。如果是目的条带有两条,那么可能是引物出现了错配,也有可能是本身就有两种可能。回收测序即可。追问:两条带距离很近,一条很亮一条很暗,用的DNA基因组回答:基因组DNA的话有杂带几乎不可避免,因为错配可能很大,挺正常的。如果两条带距离很近、又基本符合你目的片段的大小的话,可以继续跑胶让它们分开一些,然后切胶回收,连接T载体,转化涂板,挑菌测序。挑对的就行了。
不是,根据你的质粒载体序列,如果你的质粒载体序列里面有M13序列就可以用,可以用的比如生工的PUCm-T载体.
当然可以阿 M13通用引物测序跟哪来的片段没关系的 只要你把那个片段倒入M13噬菌体载体就ok
这种现象我也出现过,我分析的可能是因为M13引物自身的特性,如果P长片段,很可能会非特异的与质粒基因组DNA结合或者与质粒结合而产生长度在2000bp左右的条带,会很难验证克隆是否成功。所以,建议用目的片段的特异引物进行PCR反应,或者直接送测序。
呵呵,我以前也遇到过类似情况,至今不知道原因。可能是平板上连接产物残留污染。
建议检测克隆的退火温度提高至60-62度,挑取菌体尽量不要沾上培养基尽量少。
做PCR都要考虑Tm值吧。M13引物一般是M13F, M13R;M13F(-47), M13R(-48)配对使用。如果做菌落PCR验证阳性克隆的话,如果只是把目的片段插入到多克隆位点处,这两对引物哪一对都可以的。如果是样品需要测序的话,由于接近引物的读出效果不好,如果克隆的位点接近CMS的两端,一般需要用M13F(-47), M13R(-48)来测序。
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发布时间:2024-01-21 08:47
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